医院1952年开展了门诊眼科专科业务，1958年由眼、耳鼻喉和口腔三个专业组建五官科病房， 2012年3月眼科独立建科，正式成立。科室位于门诊内科综合楼5楼北侧，下设床位30张，杨锐任主任，景风玲任护士长。科室共有医护人员22人，其中正高级职称1人、副高级职称1人、中级职称4人、医师5人、护师4人，护士7人。

科室目前拥有美国UⅡ超声乳化机、美国准分子激光治疗机，眼科手术显微镜、光学相干断层扫描仪（OCT）、眼底荧光造影机、532眼底激光治疗仪、YAG前节激光治疗仪，全自动电脑验光仪、视觉电生理检查仪、眼部AB超声诊断仪、全自动电脑视野计、快速压力蒸汽灭菌器、冷冻器，非接触式眼压计、角膜地形图、裂隙灯、直接眼底镜，间接眼底镜等先进设备。

科室以眼专科手术室、视光学准分子激光治疗中心、眼底病诊断的光学相干断层扫描（OCT）、眼底荧光造影仪器和眼底病治疗的眼底激光、眼内注射各类药物为依托，全面开展了眼科的各种疾病的诊断和治疗，开展的业务覆盖了眼部常见病、多发病、眼内异物、眼部屈光、眼部肿瘤、眼部外伤、眼部整形等各种疾病。近几年在本地区开展多项新业务、新技术，如：近视眼准分子激光矫正术、白内障超声乳化+人工晶体植入术、羟基磷灰石义眼台植入术、泪小管断裂吻合术、难治性青光眼的手术治疗、翼状胬肉切除+干细胞移植（或羊膜移植）手术、斜视矫正手术等。

科室近几年来在国内外医学杂志发表医学科研论文20余篇。获得4项眼科国家实用新型专利；已鉴定了多项市级科研课题。其中《自制“Ｊ”形探针引导并留置硅胶管在泪小管断裂吻合术中的临床应用》、《改良式羟基磷灰石义眼台1/2自体巩膜腔内植入的临床应用》、《90刀头薄瓣在准分子激光屈光性角膜手术中的临床应用》分别获酒泉市科技进步一等奖；《额肌瓣直接悬吊术矫治重度上睑下垂的临床应用研究》获酒泉市科技进步二等奖：《定量滤过复合式小粱切除术治疗青光眼36例临床应用》获酒泉市科技进步三等奖。